Jeffrey Wang
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使用 Golang 快速实现布谷鸟过滤器解决大数据判重问题

使用 Golang 快速实现布谷鸟过滤器解决大数据判重问题

前言

业务中时常会有类似检索一个元素是否在集合中这样的场景,如果对时间和空间要求不高,我们可能会

  • 查表,或者建唯一索引避免重复插入

  • Redis 中使用 set 或者类似 hash 表的数据结构,将数据做 hash 后放到 key 上,以待后续查询

而当我们有大量数据需要判重并且业务允许小概率误阳判断的前提下

  • 使用布隆过滤器做大量数据隶属判断,但由于底层实现的原因,无法删除历史已加入集合的数据

  • 使用布隆过滤器的升级版,比如 counting bloom 就可以支持删除,但代价是三到四倍的空间占用

但 2014 年的时候,我们有了另一个选择,外网有位大哥提出了布隆鸟过滤器来解决大量数据判重的问题,并且支持删除

论文地址: https://www.cs.cmu.edu/~dga/papers/cuckoo-conext2014.pdf

国内翻译:布谷鸟过滤器:实际上优于布隆过滤器

开源实现:cuckoo-filter/cuckoofilter.go at main · linvon/cuckoo-filter · GitHub

译者非常之有耐心,翻译到位并解答了我在理解过程中产生的部分疑惑,👍

通读论文和部分代码后,大致理解了其实现原理,觉着这个算法非常巧妙,就产生了自己动手实现加深理解的想法

通过博客记录下来,同时也让读者能更快的掌握其中关键,不必通读论文和实现代码

PS:上面给到的开源实现也是 Golang 做的,自定义参数的功能强大,但定制性高带来的就是底层实现复杂,不便于初学者理解

实现关键

数据结构

理解一个算法第一步就是了解它的存储结构,理解底层数据结构后,算法随后的巧妙构思都会围绕数据结构展开

普通的 Hash

众所周知,普通的 Hash 表的工作原理是给内容生成一段 “唯一”的摘要,然后映射到索引数组上,并在数组的每一项上外挂链表或者数组开放寻址以解决 Hash 冲突

结构大概是这样的:

网上找了一篇介绍普通 Hash 的文章,如有不理解可通读此篇:Hash表 - Matrix海子 - 博客园

布谷鸟 Hash

而布谷鸟 hash 不同,分为如下几个概念

  • 指纹:原始数据生成的 “唯一” 标志

  • 桶:对应一个数组,每个桶可以存储多个指纹

  • 桶数组:对应多个桶,可以理解为一个存指纹的二维数组

【重点】 布谷鸟 Hash 在插入数据时是这样维护桶数组的:

  • 通过两个 hash 函数和原始数据 x 算出两个候选桶的位置,称为 h1 和 h2

  • 从 h1 桶和 h2 桶中随机找一个放数据指纹

  • 一个桶可存储的指纹是有限的

    • 如果没满,就往后追加存储即可

    • 如果存满了,就在桶中随机找一个位置,把原有的踢出去,新的指纹放到那个位置

  • 如果过程中踢出去了(Kick out)一个元素,被踢出去的元素就会找其对应的另一个候选桶

    • 比如某个元素 x,有固定的两个候选桶 hx1 和 hx2,通过随机选择顺利的将指纹存放到了 hx1 中

    • 然后新加了一个元素 b,有固定的两个候选桶 hb1 和 hb2,但不巧的是 hb1 和 hx1 相同 (hb2 和 hx2 再次相同的概率比较低,所以先不考虑这个情况)

    • 假设元素b 对应的两个候选桶都满了,通过随机选择,选到了 hb1(也就是 hx1)中元素 x 的指纹,x 的指纹就被踢出去了

    • x 的指纹踢出去之后放哪儿呢,它还有另一个选择就是 hx2,通过 hash 算法找到 hx2

      • 如果 hx2 未满,将 x 的指纹加进去

      • 如果 hx2 满了,将 x 的指纹加进去,随机踢一个出去,重复上述过程,直到成功或者超出最大踢出限制

这样做就会始终保证某个元素 x 对应的指纹一定在 hx1 桶或者 hx2 桶中,查找和删除的时候就顺着这个规律找即可

由于布谷鸟哈希并不存储原文,仅存储 “唯一” 指纹,上述设计还有几个隐藏的问题:

  • 布谷鸟 Hash 没有存储原文,踢出元素时我们只会获取到 hx1(或 hx2)以及指纹,怎么从 hx1 推算出 hx2呢?(或者反过来)

  • 指纹是有长度限制的,如果设置过短,指纹冲突的可能性就很高,比如 8 位指纹最多能表示 2 的 8 次方个指纹,也就是 256 种,指纹的冲突会不会导致阳性率升高呢?

  • 如果我们插入很多重复的元素,他们的候选桶一样,指纹也一样,踢来踢去也插入不进去,这个过滤器不就陷入死循环了?

【重点】踢出时 h1 和 h2 候选桶之间的转换

标准的布谷鸟 hash,确实是需要用两个 Hash 算法,通过原文算出两个候选桶的

但布谷鸟过滤器里边,对这个 hash 计算做了优化,设计了一个公式可以让 h1 和 h2 互相转换

h1(x) = hash(x), h2(x) = h1(x) ⊕ hash(x’s fingerprint)

两者可以通过同一个公式相互转换

h1(x) = h2(x) ⊕ hash(fingerprint)

h2(x) = h1(x) ⊕ hash(fingerprint)

所以踢出时只需要使用指纹和其中一个候选桶,就可以求到另一个候选桶的位置了

指纹过短的冲突

指纹设置很短造成表达能力有限,比如 8位最多表示 256 个指纹,但并不代表布谷鸟 Hash 整体表达能力有限

举个例子,假设我们做了 8 位指纹,有个 1024 个桶

假设有这么一个特殊数据 a 和 b,他俩指纹相同,但通过 hash 映射到的候选桶却不一定相同,因为指纹的生成和桶的选取是两个过程

假设再有一个特殊的数据 c 和 d,他俩指纹相同,而且两个候选桶也一致,那么这两个数据就会有假阳性,也就是如果我把 c 放入了布谷鸟过滤器中,我判断 d 是否存在于过滤器中,会返回 true

扩展下,可以根据参数推算出假阳性碰撞的概率,只有指纹相同和 hash 候选桶相同才会有阳性,引用论文的描述

让我们首先推导给定一个含有q个项的集合在同一个桶中碰撞的概率。假设第一个项x有它的第一个桶 i_1 和一个指纹 t_x。如果其他 q-1 个项和这个项 x 有相同的两个桶,它们必须3:

(1)具有相同的指纹,发生概率为 1/2^f

(2)第一个存储桶为 i_1或 i_1⊕h(),发生概率为2/m

因此,这些q个项共享相同两个存储桶的概率为 (2/m·1/2^f)^q-1

重复数据导致无限踢出

这个问题是切实存在的,假设每个桶可以存 b 个指纹,那么不难想到,重复元素最多能占用 2 * b 个空间,然后就踢不动了

所以要么就是先判重再加入,就不会有这个问题,所以要么就是重复数据不要超过预设

代码拆解

完整代码可于 code/cuckoo-filter 处查看,包含基础实现和部分核心用例

基础对象定义和操作

这个的约束都是有作用的,以便将实现复杂度约束在一篇博客的范围内

  • 桶的数量转换为 2 的次幂是因为 2的次幂取余数有快捷的位运算算法

  • 指纹的位数一定要是 8 的倍数,因为 8 位是一个字节存起来比较方便,指纹位数右移3就是需要的字节数了

  • bucket 用 uint8,也是因为 uint8 代表一个字节,跟指纹的位数尽可能匹配起来,判空也方便,用 byte 也是一样的效果

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const MaxKickOut = 500

type CuckooFilter struct {
m uint64 // 有多少个桶,强制转换为 2 的次幂
b uint64 // 每个桶能存多少个指纹
f uint64 // 每个指纹多少位,方便实现,需要是 8 的倍数,且小于 24 * 8,不然 hash 不够用
bucket []uint8 // 实际存放桶的空间
}

// New m 为桶的数量,b 为每个桶内含指纹数量,f 为指纹长度,New(1<<10, 4, 8)
func New(m uint64, b uint64, f uint64) (*CuckooFilter, error) {
// 确保 m 为 2 的 n 次幂,确保 f 为 8 的倍数
if !checkPow2(m) {
return nil, errors.New("m needs 2^n")
}
if remain, err := fastRemain(f, 8); err != nil || remain > 0 || f < 8 {
return nil, errors.New("m needs 8*n and > 0")
}
return &CuckooFilter{
m: m,
b: b,
f: f,
bucket: make([]uint8, m * b * (f >> 3)), // 分配的 bit 大小是 m * n * f/8
}, nil
}

// checkPow2 检查是否为 2 的整次幂
func checkPow2(a uint64) bool {
return a & (a-1) == 0
}

// fastRemain 求 a % b,前提是 b 需要是 2 的次幂, remain = a & (b - 1)
func fastRemain(a uint64, b uint64) (uint64, error) {
if !checkPow2(b) {
return 0, errors.New("fast remain failed")
}
return a & (b - 1), nil
}
【核心】计算 h1 、 finger 以及 h2

计算比较简单,只是取了个巧,借助 sha256 返回的固定 32 字节数据,首 8 字节取出来正好可以表达 uint64,对桶数量取余即可得到 h1,后面还剩 24 个字节,根据配置的 f 需要几个字节就取几个字节

h2 就根据公式计算即可

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// CalcHash 计算 h1 的,具体分配到哪个桶,sha input % m
func (f *CuckooFilter) CalcHash(input []byte) (h1 uint64, err error) {
// m 最多 8 字节,返回固定 32 字节的数据,取余即可
sum := sha256.Sum256(input)

// 取首 8 字节,转为 uint64
h1, err = fastRemain(binary.BigEndian.Uint64(sum[:8]), f.m)
if err != nil {
return
}
return
}
// CalcFinger 计算指纹
func (f *CuckooFilter) CalcFinger(input []byte) []byte {
sum := sha256.Sum256(input)

return sum[8:8+f.f>>3]
}

// AltHash 计算 h2 以及 KickOut 的新位置的,h1 ^ sha finger % m
func (f *CuckooFilter) AltHash(h uint64, finger []byte) (uint64, error) {
fingerHash, err := f.CalcHash(finger)
if err != nil {
return 0, err
}

return h ^ fingerHash, nil
}

桶的基础操作

包含桶是否有空位,桶内是否有目标指纹,桶特定位置的指纹数据,桶特定位置替换等等基础功能,本质上就是对 bucket 数组的操作,供随后的上层操作调用

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// CheckBucketFull 检查桶是不是满的,检查最后一个 finger 即可
func (f *CuckooFilter) CheckBucketFull(index uint64) bool {
lastFinger := f.GetBucketFinger(index, f.b - 1)

for i := 0; i < len(lastFinger); i++ {
if uint8(lastFinger[i]) != 0 {
return true
}
}
return false
}

// CheckBucketHaveFinger 检查桶内是否有这个指纹
func (f *CuckooFilter) CheckBucketHaveFinger(index uint64, finger []byte) bool {
empty := f.GetEmptyFinger()

for i := uint64(0); i < f.b; i++ {
currFinger := f.GetBucketFinger(index, i)
if bytes.Equal(currFinger, finger) {
return true
}
if bytes.Equal(currFinger, empty) {
// 空了就不用比了
return false
}
}
return false
}

// InsertBucket 桶内插入数据
func (f *CuckooFilter) InsertBucket(index uint64, finger []byte) error {
empty := f.GetEmptyFinger()
// 找到一个空的位置就可以放进去了
for i := uint64(0); i < f.b; i++ {
currFinger := f.GetBucketFinger(index, i)
if bytes.Equal(currFinger, empty) {
f.ReplaceBucket(index, i, finger)
return nil
}
}
return errors.New("bucket fulled")
}

// ReplaceBucket 替换 Bucket 中某个 finger
func (f *CuckooFilter) ReplaceBucket(index uint64, bucketIndex uint64, finger []byte) []byte {
origin := f.GetBucketFinger(index, bucketIndex)

for i := 0; i < len(finger); i++ {
origin[i] = finger[i]
}

return origin
}
func (f *CuckooFilter) GetBucketFinger(index uint64, bucketIndex uint64) []byte {
fingerByte := f.f>>3
bucketBase := index * f.b * fingerByte

return f.bucket[bucketBase+bucketIndex*fingerByte:bucketBase+(bucketIndex+1)*fingerByte]
}

func (f *CuckooFilter) GetEmptyFinger() []byte {
fingerByte := f.f>>3
return make([]byte, fingerByte)
}

// RandomReplaceInFullBucket 随机替换满桶中的某个 finger
func (f *CuckooFilter) RandomReplaceInFullBucket(index uint64, finger []byte) (replaceFinger []byte, err error) {
if !f.CheckBucketFull(index) {
return nil, errors.New("bucket not full")
}
randomIndex := uint64(rand.Intn(int(f.b)))

replaceFinger= f.ReplaceBucket(index, randomIndex, finger)

return
}

// DeleteFingerFromBucket 从桶中删除 finger,类似数组操作
func (f *CuckooFilter) DeleteFingerFromBucket(index uint64, finger []byte) error {
empty := f.GetEmptyFinger()

for i := uint64(0); i < f.b; i++ {
currFinger := f.GetBucketFinger(index, i)
if bytes.Equal(currFinger, finger) {
f.ReplaceBucket(index, i, empty)
for j := i; j < f.b; j++ {
if j == f.b-1 {
f.ReplaceBucket(index, j, empty)
} else {
nextFinger := f.GetBucketFinger(index, j + 1)
f.ReplaceBucket(index, j, nextFinger)
}
}
return nil
}
}
return errors.New("finger not found")
}

// GetHashFinger 获取 finger
func (f *CuckooFilter) GetHashFinger(input []byte) (h1 uint64, h2 uint64, finger []byte, err error) {
h1, err = f.CalcHash(input)
if err != nil {
return
}

finger = f.CalcFinger(input)

h2, err = f.AltHash(h1, finger)

return
}

判断包含

在上面实现的桶基本功能前提下,包含就很简单了,看是不是在 h1 和 h2 里就好

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// Contain 是否包含
func (f *CuckooFilter) Contain(input []byte) (bool, error) {
h1, h2, finger, err := f.GetHashFinger(input)
if err != nil {
return false, err
}
return f.CheckBucketHaveFinger(h1, finger) || f.CheckBucketHaveFinger(h2, finger), nil
}

插入

插入相对比较复杂,整体思路也围绕着

  • h1 和 h2 有空的就放进去

  • 没有空的就随机把元素踢出去,把换出来的元素换个地方存

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// Add 加一个
func (f *CuckooFilter) Add(input []byte) error {
h1, h2, finger, err := f.GetHashFinger(input)
if err != nil {
return err
}

h1Full := f.CheckBucketFull(h1)
h2Full := f.CheckBucketFull(h2)

rand.Seed(time.Now().UnixNano())
if !h1Full || !h2Full {
index := uint64(0)
if !h1Full && !h2Full {
// 随机选择 h1 和 h2,有空位就插入
if rand.Intn(2) > 0 {
index = h1
} else {
index = h2
}
} else if !h1Full {
index = h1
} else {
index = h2
}
// 放到桶里
err = f.InsertBucket(index, finger)
if err != nil {
return err
}
// 成功
return nil
} else {
// kick out
// 随机选择 h1 和 h2
currIndex := uint64(0)
if rand.Intn(2) > 0 {
currIndex = h1
} else {
currIndex = h2
}
currFinger := finger
for i:= 0; i < MaxKickOut; i++ {
if f.CheckBucketFull(currIndex) {
// 满了没空位,就随机替换出来
currFinger, err = f.RandomReplaceInFullBucket(currIndex, currFinger)
if err != nil {
return err
}

// 把换出来的数据,换一个桶存
currIndex, err = f.AltHash(currIndex, currFinger)
if err != nil {
return err
}
} else {
// 有空位就插
err = f.InsertBucket(currIndex, currFinger)
if err != nil {
return err
}
// 成功
return nil
}
}

return errors.New("over max kick out")
}
}

删除

整体逻辑就是,h1 和 h2 能找到就删,找不到就删不了

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// Delete 删除一个
func (f *CuckooFilter) Delete(input []byte) error {
h1, h2, finger, err := f.GetHashFinger(input)
if err != nil {
return err
}

// 如果能找到的话,就删掉
if f.CheckBucketHaveFinger(h1, finger) {
return f.DeleteFingerFromBucket(h1, finger)
}
if f.CheckBucketHaveFinger(h2, finger) {
return f.DeleteFingerFromBucket(h2, finger)
}

return errors.New("finger not found")
}

测试用例

最基本的用法如下,结果应该是 false, true

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func main() {
filter, err := New(1<<5, 2, 8)
if err != nil {
fmt.Println("err", err)
return
}

_ = filter.Add([]byte("Hello"))
_ = filter.Add([]byte("World"))

res1, err := filter.Contain([]byte("hello"))
res2, err := filter.Contain([]byte("Hello"))

if err != nil {
fmt.Println("filter contain", err)
return
}

fmt.Println("hello", res1, "Hello", res2)
}

扩展一些特殊的情况,比如插入大量重复数据造成的踢出超限,判重,删除等等,可参见代码中的 filter_test.go

执行 go test . 运行测试用例的结果

总结

布谷鸟过滤器,算法确实挺奇妙的,但理解了其中数据结构以及核心的 h1 、h2 、finger 之间的运算和转换关系,就会变的简单起来。

本文作者:Jeffrey Wang
本文链接:https://blog.wj2015.com/2022/05/17/%E5%B8%83%E9%9A%86%E9%B8%9F%E8%BF%87%E6%BB%A4%E5%99%A8%E7%9A%84%E5%88%86%E6%9E%90%E5%92%8C%E5%AE%9E%E7%8E%B0/
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